Una noticia positiva en el campo de la salud. Investigadores de la Universidad de Gothenburg han desarrollado un modelo de Inteligencia Artificial (IA) que incrementa el potencial para detectar el cáncer a través de análisis de azúcar. Este modelo llamado “Candycrunch” es más rápido al encontrar anormalidades que los actuales métodos semimanuales.
El análisis de las moléculas de azúcar en las células
Los glicanos, o estructuras de las moléculas de azúcar en nuestras células, se pueden medir mediante espectrometría de masas. Estas estructuras pueden indicar diferentes formas de cáncer en las células.
No obstante, a la fecha son los humanos los que deben analizar cuidadosamente los datos de la medición del espectrómetro de masas para determinar la estructura a partir de la fragmentación de glucanos. Este proceso es engorroso y puede llevar desde horas hasta días para cada muestra. Además, un pequeño número de especialistas en el mundo son capaces de realizarlo con seguridad debido a que se trata prácticamente de un ‘trabajo de detective’ aprendido durante años.
Candycrunch
Automatización del ‘trabajo de detective’
Lo que hicieron los científicos de la Universidad de Gothenburg es desarrollar un modelo de IA que automatiza este trabajo de detective. Este modelo ha sido denominado “Candycrunch” y resuelve la tarea en solo segundos, de acuerdo con el estudio publicado en Nature Methods.
El modelo de IA fue entrenado utilizando la base de datos de más de 500,000 muestras de distintas fragmentaciones y estructuras asociadas de moléculas de azúcar.
“La formación ha permitido a Candycrunch calcular la estructura exacta del azúcar en una muestra en el 90 por ciento de los casos”, sostuvo Daniel Bojar, profesor asociado de bioinformática en la Universidad de Gothenburg.
Nuevos biomarcadores
A partir de este logro, el modelo de IA pronto podría alcanzar los mismos niveles de precisión que la secuenciación de otras secuencias biológicas, como el ADN o el ARN. Asimismo, como Candycrunch es tan rápido y preciso, puede acelerar el descubrimiento de biomarcadores basados en glicanos tanto para el diagnóstico como para el pronóstico del cáncer.
Candycrunch también es capaz de identificar estructuras que los análisis humanos a menudo pasan por alto debido a sus bajas concentraciones. Por tanto, el modelo puede ayudar a los investigadores a encontrar nuevos biomarcadores basados en glicanos.
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